對於新生寶寶是否要進行包皮割除手術，一般分成兩派說法，贊成小兒割包皮的理論認為，割除包皮能有效提升衛生清潔，減少藏汙納垢等感染機會；而反對派則認為若過早割除包皮可能會導致包皮切除過多，影響尿道開口或手術導致的出血、發炎等問題。
割除包皮的正式學名為「包皮環切術」，屬於不需住院的門診手術，有些人認為，只要保持良好的衛生習慣，避免髒汙引起感染發炎，不但能免於手術帶來的危險與併發症，包皮還能提供對龜頭的保護，保留其敏感度。
男寶貝「包莖」狀況題
在未割除包皮前的正常狀況之下，龜頭應被包皮包裹住，當陰莖勃起時，包皮會自動向後退縮，使龜頭向外顯露。一般來說，0～3歲寶寶的包皮本就處於包覆龜頭的狀態，屬於正常現象，無須治療；3～6歲左右，龜頭開始慢慢外露，因此若寶寶6歲後的包皮開口仍過於狹窄，龜頭無法順利露出，則稱之為「包莖」。
另外，如果是因為包皮過長導致清潔不良，或是包皮處有傷口結痂，使包皮無法退縮，也是包莖的其中一種狀況。當寶貝發生包莖現象，可能會造成尿液及腺體分泌物囤積在包皮內，因而產生包皮垢過多或是感染狀況，嚴重甚至會引起膿瘍，似懂非懂的幼兒可能會對父母形容「小鳥痛痛的」，此時爸比媽咪除了協助寶貝清潔藏匿於包皮裡的汙垢，更應請求醫師協助。新光醫院小兒外科主任張嘉宇表示，發生包莖現象時，一般不會建議馬上進行手術，而是以局部抗生素消炎藥膏治療為主，並輔以清潔衛教。發炎狀況好轉後，通常醫師開立的類固醇藥膏，對治療包莖的效果顯著，能使包皮開口逐漸變得鬆軟，讓幼兒得以推開包皮清洗汙垢；倘若治療無效，仍反覆發炎，才會評估是否有進行包皮切除手術的必要。
包皮過長易引起感染
另一種狀況，若寶貝的包皮將龜頭完全覆蓋，但包皮開口大小正常，能夠翻露出龜頭，則可能只是包皮過長。基本上包皮過長並無大礙，若沒有發炎跡象，一般來說不必手術，但若未經常清潔乾淨，仍會因藏汙納垢使包皮及龜頭增加發炎機率，甚至引起皮膚起疹子或有搔癢感，建議父母若發現寶貝的包皮長度較長，可於沐浴時將其輕輕翻開清洗。張嘉宇主任提醒，翻開包皮時，應「適可而止」，不必勉強「完全」翻開，以免造成局部破皮或撕裂傷，導致破皮結痂後形成包莖，反而讓寶貝承受不必要的手術之苦。
