新生兒剛出生時，頭骨之所以未閉合留下囟門的位置，是因為生產時必須經過產道，軟軟的囟門比較能使新生兒順利誕生而不會被卡住，這是與生俱來的暫時功能、是頭骨中間的縫隙，也提供醫師觀察寶寶是否生病的線索與指標。一旦囟門閉合之後，就無法透過囟門來觀察是否生病了。
☆ 囟門凹陷：嚴重脫水、嘔吐皆會使囟門凹陷。
☆ 囟門凸起：腦壓上升、顱內出血、腦膜炎等會使囟門凸起。
囟門的位置
囟門的位置如附圖所示。前囟門位於頭頂；後囟門則位於後腦勺的位置。我們一般所說的囟門多指前囟門。當囟門尚未閉合時，並沒有頭骨保護，觸摸時會感到很柔軟、並可觸摸到脈搏跳動。
薛常威主任表示，後囟門比較早閉合（閉合後會被頭骨保護，不會再摸到軟軟的囟門，而會摸到硬硬的頭骨），大約出生2個月左右就會關閉；前囟門的閉合時間則每個人不同，多數嬰幼兒前囟門閉合的時間為6～18個月，也有少數人直到2歲前囟門尚未關閉。
如果寶寶囟門遲遲未閉合或太早就閉合，是否也代表罹患疾病的可能性？薛常威主任指出，即使時間到了囟門還沒閉合，大多數都屬於正常的情形，家長不用太擔心，只要持續觀察寶寶的頭圍與發展皆正常即可，多數囟門還是會自行閉合；至於少數情況的確可能反映出疾病的警訊，例如：先天性甲狀腺功能低下（不過從新生兒篩檢其實就能夠判斷）；另如腦壓太高或水腦，也會導致囟門比較晚閉合。
相反地，如果時間還沒到，囟門就已經提前關閉，則可能與先天小腦症有關，這是屬於正常的變異。但有少部分是因為先天性大腦發育異常，或因為腦傷、腦膜炎所引起大腦萎縮、不發育，這些因素也會使得囟門提前關閉。
