中國大陸武漢市近期陸續出現不明原因病毒性肺炎個案，截至2020/1/8共累計59例，其中有7例重症（中國大陸官方公告疫情統計數據自1月5日後未更新）。為了因應武漢肺炎疫情，疾管署自2019/12/31啟動由武漢直航入境班機之登機檢疫，已執行14航班，共檢疫1,317名旅客及機組員，目前有症狀者共10名，有1名驗出H3N2流感病毒（屬登機檢疫有症狀者）、1名檢出H1N1流感病毒，但經評估後皆未後送，目前症狀皆已改善恢復中，由地方政府衛生局持續追蹤關懷。
但仍有一名學齡前男童，登機檢疫時發現有發燒、咳嗽症狀，符合後送就醫條件疾管署副署長莊人祥表示，該名男童曾住在武漢，沒有與不明肺炎病例接觸過、沒有去過華南海鮮市場，也未到當地醫療院所，但他於1/8返台時出現咳嗽、發燒、流鼻水等症狀，目前確診為「人類間質肺炎病毒」，正在醫院治療中。
此外，人類間質肺炎病毒感染也可能引發支氣管炎或肺炎，與其他病毒引起的上呼吸道和下呼吸道感染類似。
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疾管署表示，日前已接獲陸方通知，病原體初步判定為新型冠狀病毒，核酸檢測結果共15例陽性，已完成病毒全長基因定序，電子顯微鏡下亦呈典型冠狀病毒型態。
大部分的冠狀病毒傳播途徑主要是經飛沫傳染，近距離、長時間接觸者、或直接或間接接觸到感染者分泌物等感染機會最大。有部分動物的冠狀病毒會讓動物出現腹瀉症狀，可以在糞便當中找到病毒，可能藉此造成病毒傳播。
新型冠狀病毒潛伏期約為7〜10天，此次已確定的病例主要是發生急性嚴重呼吸系統疾病，如：咳嗽、發燒、肺炎的呼吸道相關症狀。一般人類感染冠狀病毒以5歲以下兒童為主，但也有成年人與老年人罹患肺炎的報告，或使得原先的慢性阻塞性肺病之病情加重，偶爾有死亡個案但比例甚低。
目前所有的冠狀病毒並無特定的治療方式，多採用支持性療法。SARS流行期間曾有許多抗病毒藥物被使用來治療病患，但其效果均未被確認。
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由於冠狀病毒並無疫苗可接種，只能靠注意自身衛生預防，前往武漢或鄰近地區旅遊的民眾，應該遵循以下防治方法：
1.避免接觸動物或動物屍體
2.避免食用生肉或生蛋
3.避免前往禽畜市場及當地醫院，甚至接觸病患
4.落實用肥皂勤洗手
5.妥善處理口鼻分泌物
疾管署也提醒，若曾至武漢旅遊後14日內出現不適症狀者，請配戴口罩就醫，並主動告知醫師近期旅遊地點及症狀；除了就醫外，請在家休息，減少與他人接觸，打噴嚏或咳嗽時以衛生紙或衣袖掩住口鼻，避免徒手接觸。
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